Bác Sĩ Quái Dị là bộ phim kể về vị bác sĩ ngoại khoa thiên tài nhưng quái dị Black Jack. Điểm quái dị đầu tiên là trên mặt anh mang hai màu da khác nhau, đó là kết quả của một cuộc phẫu thuật sau một tai nạn từ nhỏ. Vì vậy, vẻ ngoài của Black Jack luôn mang đến sự khiếp sợ cho người đối diện.
Thứ hai, Black Jack là bác sĩ mà luôn hét giá trên trời, điều đó khiến liên đoàn thầy thuốc trong nước không chấp nhận cấp giấy phép cho một bác sĩ như anh. Vì vậy, anh luôn là cái gai trong mắt những thành viên của hiệp hội này, cũng như của rất nhiều các bác sĩ khác. Họ lên án Black Jack là thiếu đạo đức nghề nghiệp. Nhưng mỉa mai thay, khi chỉ có Black Jack mới có thể thực hiện những các ca mổ khó, mà một bác sĩ bình thường không thể thực hiện được. Tuy nhiên, bản chất Black Jack là một người vô cùng thẳng thắn, nhân từ và rộng lượng, nhưng không phải với tất cả mọi người. Black Jack chỉ lấy tiền đối với những người anh không thích, còn với những ca mổ đặc biệt anh sẽ làm không công và rồi miệng lại càu nhàu một câu quen thuộc "lại làm không công nữa rồi".